Windows e PipeLine sono simili gli uni agli altri in molti modi. Entrambi sono altamente personalizzabile, che consente di aggiungere funzionalità aggiuntive che potrebbero altrimenti impossibili con il pacchetto software di Windows. PipeLine consente un maggiore controllo del software, mentre Windows offre un maggiore controllo dell'utente su software stesso. In questo caso, saremo confrontando i due programmi, così come Windows Vista e Windows 7.
Una delle principali differenze tra i due programmi è il fatto che è possibile scaricare solo la versione Windows del programma. PipeLine consente agli utenti di scegliere tra un assortimento di temi e suoni che gli utenti Windows non possono scaricare. Lo stesso vale per Windows Vista. Entrambi i programmi offrono semplici procedure di installazione e configurazione, consentendo agli utenti di eseguire il giusto software, fuori dalla scatola. Mentre gli utenti di Windows avranno la possibilità di scaricare e installare altri programmi, entrambi sono alquanto restrittiva quando si tratta di aggiungere applicazioni di terze parti.
Un'altra differenza notevole tra i due programmi è il fatto che Windows non supporta lettori video di terze parti, come ad esempio Xbox Live. In aggiunta a questo, Windows Vista ha una limitazione di due giochi installati in una singola installazione. Di Windows non supporta anche il download di video o file audio da internet. Infine, entrambi i programmi consentono agli utenti di connettersi a stesso fornitore di servizi, tuttavia, gli utenti di Windows potranno ottenere solo l'accesso ad alcuni fornitori di banda larga.